С первых дней Великой Отечественной войны Пейсаховский на фронте. Сначала – политрук, а после переподготовки в военной академии имени Фрунзе командует 164-м полком 33-й стрелковой Холмской Краснознаменной дивизии. Воюет в Прибалтике, Восточной Пруссии, Германии.
«Сочетая личную храбрость и мужество с умелым руководством подразделениями, …принимал правильные решения и действовал решительно, смело. Не давая врагу закрепиться, Пейсаховский беспрерывно преследовал его, наседал, вводил в бой батальоны там, где противнику было невыгодно… Когда воины попадали в затруднительные положения, когда нужно было сделать решительный рывок, в боевых порядках батальонов и рот появлялся командир полка, и это усиливало наступательный порыв воинов», – вспоминал о Пейсаховском командир дивизии генерал-майор Василий Смирнов.
Так было и в мае 1945-го. Над рейхстагом уже реяло Знамя Победы, но последние силы противника продолжали оказывать сопротивление. Под сильным обстрелом бойцы 164-го полка залегли. Тогда подполковник Пейсаховский поднялся и с криком «Вперед!» первым пошел в атаку. Спустя несколько часов гитлеровцы капитулировали. Наум Пейсаховский в этом бою получил седьмое, самое тяжелое ранение, почти ослеп. Узнав о подвиге командира, к нему лично приехал маршал Жуков, чтобы сообщить о награждении званием Героя Советского Союза. Он же посодействовал, чтобы Пейсаховского прооперировал офтальмолог с мировым именем Владимир Филатов. Зрение на одном глазу удалось сохранить.
Наум Пейсаховский служил в армии до 1953 года. Жил в Москве. Не раз бывал на малой родине, где встречался с земляками, был почетным гостем на торжественных мероприятиях. Наум Григорьевич прожил долгую жизнь и умер в 1999 году.